把濾膜放在紙巾上于室溫晾干后，把濾膜（編號面朝上）放在一張保鮮膜上，并在保鮮膜上作幾個不對稱的標記，以使濾膜與性自顯影片位置對應。
用第二張保鮮膜蓋住濾膜。加光片并加上增感屏于-70℃曝光12-16小時。
底片顯影后，在底片上貼一張透明硬紙片。在紙上標記陽性雜交信號的位置，同時在不對稱分布點的位置上作出標記。可從底片上取下透明紙，通過對比紙上的點與瓊脂上的點來鑒定陽性菌落。
怎樣保證原位雜交實驗操作時的溫度?
建議儀器操作，人工操作的話要注意：
（1）對熒光原位雜交操作過程中可能使用的一些儀器進行溫控檢查，不符合要求的進行更換。
（2）盡可能地保持環境溫度在20度以上。
（3）針對需要預熱以達到要求溫度的試劑，在使用前必須使用溫度計對其進行測溫。
（4）同時檢測的樣本不超過4塊，操作一定要迅速，實驗人員要注意一些小部件的溫度，尤其是在冬季。
植物原位雜交除了在遺傳育種方面的應用，還在其他領域有著廣泛的應用，包括：
植物基因表達模式研究：通過植物原位雜交技術可以檢測特定基因在不同組織或不同生長條件下的表達模式，有助于了解基因的功能和作用機制。
植物基因組研究：植物原位雜交技術可以用于基因組研究，例如染色體構象、基因組變異和基因組進化等方面，有助于深入了解植物基因組的特征和結構。
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