同一樣本可以多次做原位雜交實驗嗎?
一般情況下,如果操作沒有得到理想的結果,是可以將探針洗滌然后進行再次的雜交的。如果使用的是直標型探針,還可以使用不同探針對同一樣本進行反復雜交。針對不同的樣本,處理方法略有不同。
原位雜交實操中哪些因素比較重要?
重要的因素:溫度、光照、濕度和試劑的PH值。溫度和濕度直接影響著探針和目標DNA的雜交效率;光照影響著熒光染料的強度,所以探針要避光保存,其已經雜交的片子可用防熒光淬火劑封片且避光保存;各種試劑pH也要達到要求,這也直接關系到原位雜交的穩定性。
植物組織原位雜交的步驟包括以下幾個方面:
1. 制備組織樣品:從植物中取出需要研究的組織樣品,如根、莖、葉等。
2. 固定組織樣品:將組織樣品固定在載玻片上,通常使用或乙醇等化學物質進行固定。
3. 處理組織樣品:對固定的組織樣品進行脫水、透明化、脫脂等處理,以便于DNA探針的穿透和結合。
4. 制備DNA探針:根據需要研究的基因序列,設計并合成DNA探針。DNA探針可以標記熒光染料或性同位素,以便于檢測。
5. 雜交DNA探針:將DNA探針與組織樣品進行雜交,通常需要在高溫下進行,以便于DNA探針與RNA或DNA結合。
6. 檢測雜交信號:通過熒光顯微鏡或計數器等設備,檢測DNA探針與RNA或DNA的結合情況,確定目標基因的表達模式和位置。
原位雜交技術可以應用于以下場景:
組織中病毒DNA/RNA的檢測和定位。例如,可以用于檢測EB病毒mRNA、人類狀瘤病毒和巨細胞病毒DNA等。
癌基因、抑癌基因及其他各種功能基因在轉錄水平的表達及其變化的檢測。
檢測染色體的變化,如染色體數量異常和染色體易位等。
在植物基因組研究中的應用。例如,通過與特定基因序列的探針進行雜交,可以在植物染色體上定位到目標基因的位置,進而構建遺傳圖譜,為植物育種和基因組研究提供基礎數據。